《墨子间诂》被公认为清代朴学家研治《墨子》重要的学术成果。该书最初以活字本形式印行,后改为刻本。其刻本即清宣统二年刊行的所谓“定本”,亦即通行本。中华书局《新编诸子集成》点校该书即以宣统刊本为底本。台湾艺文印书馆影印孙诒让先生全集,所收录的《墨子间诂》也是此本。而代表该书初形态的活字印本,迄今未见出版者,甚至连中华书局点校时亦未曾参考活字本。
《十三经注疏》是中国古文献的基础典籍,《周易》《尚书》《毛诗》《礼记》《左传》等五经注疏是其核心组成部分。在五经注疏的各种版本中,清阮元刻本体例较为完备,影响亦较为深远(至今仍为学界通行本)。